益生菌是指能和人体共生，有益健康的好菌。已有研究支持益生菌能调节免疫系统平衡，减少过敏抗体IgE产生。
而肠道是人体最大的免疫器官，70％免疫球蛋白抗体聚集在肠道，肠道里的好菌与坏菌会影响免疫系统，好菌能让肠道保持酸性，排便顺畅、抑制肠内腐败反应，坏菌则会使肠道偏碱性，产生大量有毒物质释放毒素，引起发炎反应，陆续有研究发现，肠道的疾病与糖尿病、高血压、心脏病、精神疾病、癌症等各种疾病息息相关。
医师指出，既然过敏源自免疫系统失去平衡，补充益生菌、调节肠道机能应有助改善过敏，但是，补充益生菌不等于治疗过敏，而是降低发病率。且抗过敏必须是特别挑选的菌株，效果的快慢因人而异，也有人用了没效。对孩童来说，5岁时免疫系统发育成熟，因此学龄前是最佳补充时机；过敏的成年人吃益生菌，缓解程度有限。
医师指出，目前研究显示，益生菌对改善异位性皮肤炎较有效，过敏性鼻炎和气喘则不明显，益生菌并不能取代过敏的正规治疗。
发酵乳 vs. 保健食品
益生菌（乳酸菌）产品众多，发酵乳、保健食品，各有优势，期待改善过敏困扰，又希望能把钱花在刀口上的人，以下秘诀能帮助你买到适合的产品：
▼发酵乳分成凝态（优格）、浓稠（酸奶）、稀释（如养乐多）三类。优点是价格便宜，较不会引起胀气，乳酸菌还能分解牛奶蛋白质，生成特殊胜，能调节多种生理机能。大部份发酵乳取得的健康食品字号是增加肠道益生菌，有调整过敏体质认证的不多，可选择知名品牌发酵乳，较有保障。
▼保健食品因不需考虑风味，配方更灵活，并能藉由包埋技术，让益生菌通过胃酸和胆盐的侵蚀到达肠道，效益好但价格也贵，市场紊乱，购买时可留意：
●菌株标示清楚：
包括菌名、菌株来源、生产方式。不是每种益生菌都有过敏免疫调节功能，目前国外研究较充分的有LGG、代田株，台湾则是LP33等。
●菌数在合理范围：
以现有技术，1克菌粉的益生菌含量不可能超过1000亿，而以肠道空间来说，一天400亿已接近极限，吃更多也不会更有效。
●可信赖的厂商：
如果是国内生产的产品，最好是认证的制造厂，较能确保每一批产品的质量水平及标示的正确度，进口产品则可看标示是为食品厂或药厂。
●有研发团队及愿意提供学术数据：
拿得出具可信度、能支持宣称效果的研究报告，而非只靠广告促销或名人代言。
●活菌比死菌好：
如果要兼顾抗过敏和肠道健康，应尽量选活菌。活菌保存较困难，需要冷藏，但现在也有产品运用双层包埋技术，让活菌能在常温下保存，购买前可多比较。研发出本土抗过敏益生菌LP33的许清祥医师提供一个简易辨别活菌、死菌的方法：将购买的益生菌产品加牛奶，置于室温隔夜，如果变酸乳就是活菌，发臭则是死菌。
●粉状剂型较稳定：
医师认为，锭剂除非加工技术非常好，否则益生菌容易因外力死掉，粉状剂型包装抗湿效果最好，菌的活性保存较久。
特别要提醒的是，无论是喝酸奶还是吃保健食品，再好的乳酸菌也没办法在肠道久驻，尽量天天补充。
喝酸奶最好在餐后，胃部酸度较低，乳酸菌比较能到达肠道，选择出厂日期较近的，开封后尽快喝完。
如果选择保健食品，「需连续补充6个月以上才可能改变体质，」许清祥认为，并提醒益生菌不要和抗生素、咖啡、茶一起服用，最好搭配新鲜果菜汁，促进益生菌活性和生长速度，少吃大鱼大肉以免肠道繁殖坏菌，影响效果。免疫功能差的老年人和病人，服用益生菌前应咨询医师。
